《史上最垃圾偽聖女》講述了一位名叫不動新人的日本男性，某天醒來發現自己轉生成了美少女遊戲《永遠的散花～Fiore caduto eterna～》中備受厭惡的反派角色——偽聖女艾爾莉潔。為了改變原本導致眾多角色不幸的劇情，他決定利用對遊戲的熟悉，採取各種行動。然而，儘管內心仍是男性，他的行為卻被周圍人誤解為完美的聖女，並因此受到尊敬。隨著他的行動，遊戲的內容也逐漸發生變化，讓他在不明所以的情況下，繼續改變著命運。